История Мегазоны 23 переносит зрителя в беззаботную жизнь молодого Сёго Яхаги, чьи дни вдруг меняются навсегда, когда ему достаётся необычный мотоцикл, похищенный его другом. Оборудование оказывается не просто железкой — за ним стоят секреты военных и крупная игра теней, где каждое движение может обернуться опасностью. Пытаясь распутать цепочку мистификаций, Сёго узнаёт ужасающую правду: наш мир — не естественный порядок вещей, а искусно сконструированная реальность, созданная и подчиняющаяся властному суперкомпьютеру, размещившемуся на дальнем космическом корабле. Развязка приближается, и вместе с тем над планетой нависает новая волна конфликта. Герой попадает в вихрь противостояний, где технологии, шпионаж и рискованная смелость переплетаются с его стремлением понять, кто он на самом деле и кому служит эта казалось бы привычная, но обманчивая вселенная. В преддверии столкновения судьбы героев и всего мира меняются на глазах, и исход войны остаётся неясным.
