К финалу годичной войны наступает решающий этап: после поражения на Земле силы Зеона отходят в космос, пытаясь сохранить боевые позиции среди пусков кораблей и огней лазеров. Амуро Рей всё глубже постигaет скрытые возможности своих Ньютайп-способностей и ищет способы применить их на поле боя. Ему вновь предстоит столкнуться с величайшим врагом — Чар Азнабл [シャア・アズナブル], который тоже обладает Ньютайп-законами и манерой держать удар. Надвигается эпохальное столкновение, а близкие люди снова оказываются в зоне опасности. Сможет ли Федерация Земли одолеть Герцогство Зеон, или грядущая битва принесёт сокрушительный крах надеждам союзников? Удастся ли Амуро [アムロ・レイ] доказать своё превосходство как настоящий Ньютайп и превзойти как врагов, так и собственные сомнения? В этом эпическом противостоянии в безвоздушной пустоте космоса и среди ярких лучей лазеров разворачивается судьба людей, охраняющих мир на границе звёзд и надежды дома.
