Действие аниме Обитель зла: Вырождение разворачивается осенью 2005 года, спустя год после событий Обитель зла 4. По неизвестной причине в США начинается внезапное заражение, превращающее людей в ходячих мертвецов, что захватывает пассажиров и персонал крупного международного аэропорта. Терминалы, залы ожидания и взлетно-посадочные полосы погружаются в хаос: связи прерываются, двери запираются, и паника с каждым часом нарастает. Главные герои вынуждены балансировать между стремлением к выживанию и попытками понять источник новой напасти, чья угроза выходит за пределы одной аэропортовой зоны. По мере разрастания кризиса ответственность за судьбу окружающих ложится на немалочисленную группу выживших — солдат и гражданских, оказавшихся лицом к лицу с дилеммами, страхами и предательством. В итоге последствия оказываются далеко не благоприятными: на кону жизни невинных, разрушенные планы и неопределённое будущее, которое может стать последней надеждой человечества на спасение.
