После разрушительного Четвёртого удара Евангелиона Синдзи, Аске и Рей удаётся найти укромное место среди редких очагов человеческих общин, что ещё сохраняются на разрушенной Земле. Здесь каждый из них пытается заново состроить своё существование: без прежних ролей пилотов и без привычного ритма жизни Евы они обживаются в новой реальности, где каждый шаг даётся через сомнения и поиски собственного смысла. Но спокойствие не длится долго: на горизонте зреет новая угроза, которая может привести к настоящему концу всего того, ради чего они боролись. В то же время на повестке дня стоит амбициозный проект по эволюции человечества, и организация Wille готова вступить в финальную схватку, чтобы остановить Последний удар. Сюжет сочетает личностные кризисы трёх героев с глобальной драмой выживания цивилизации, где каждый выбор способен изменить судьбу мира. В центре — противостояние между стремлением к прогрессу и ценой, которую приходится платить за будущее.
