На планете появляется загадочная организация, одержимая идеей искоренить сверхспособности и оставить в живых лишь тех, кто не демонстрирует никаких необычных талантов — так называемых «чистых» людей. Чтобы доказать свою правоту, она осуществляет террористическую акцию, применяя мощную бомбу, способную вывести силы носителей из-под контроля и превратить их в опасность для окружающих. Этот инцидент воспринимается как угроза на международном уровне, требующая срочной реакции со стороны мировых держав. В ходе расследования выясняется, что по миру разбросано ещё двадцать пять таких же разрушительных устройств. В ответ на эту угрозу Изуку Мидория и весь коллектив учеников Академии Юэй вместе с наставниками отправляются в разные регионы планеты, чтобы не допустить катастрофы и остановить событие, которое может означать конец света.
