История следует за старшеклассником Рэном Амами́ем, который становится очевидцем непристойного давления: мужчина прижимает к стене молодую девушку, игнорируя её протесты. Рэн вмешивается, и схватка заканчивается его победой, однако нападавший оказывается влиятельным политиком. Поскольку спасённая отказывается давать показания, Рэна обвиняют в хулиганстве и отправляют на год испытательного срока. Его переводят в Токио и он начинает учёбу в новой школе. В столице он обосновывается в кафе на чердаке «Леблан», где живёт старый друг родителей. Уже в первые дни он находит на своём смартфоне загадочную программу. По пути к новой школе Рэн знакомится с одноклассником Рюдзи Сакамото, и в их жизни начинается череда странных событий: они попадают в таинственный мир, известный как «Чертог», где их преследует загадочный человек, похожий на учителя физкультуры, а Рэн неожиданно открывает в себе способность, которую зовут Персона. Спасаясь из Чертога, они возвращаются в реальный Токио и решают разобраться в происходящем, чтобы наказать виновного и выяснить правду.
