Во втором тысячелетии будущего человечество сталкивается с внезапной космической угрозой — юпитерианские ящеры-агрессоры обрушиваются на колонии и базы по всей Солнечной системе. Спустя год Акито, носитель японского имени 天河 明人, чудом переживший нападение на одну из земных станций на Марсе, просыпается на Земле без ясной памяти о том, как оказался здесь. Он подрабатывает поваром и пытается собрать разрозанные фрагменты своего прошлого, ищет ответы на тревожные вопросы. Всё меняется после судьбоносной встречи с подругой детства Юрикой, которая оказывается капитаном новейшего корабля «Надэсико», созданного частной компанией «Нергал» для устранения нарастающего конфликта между силами разума. Следуя за ней, Акито становится частью экипажа, состоящего из самых необычных людей, чьи характеры и тайны держат их на грани риска. Судно с упорством прорывается к Марсу, и там, возможно, раскроется и тайна смерти родителей Акито, давая ему зацепку к ответам, которых он так долго искал.
