Это ремейк сериала 1972 года, который заложил основы жанра меха. Настоящий Мазингер Зет переносит историю в новое русло, вводя свежих персонажей и автономную сюжетную линию, не завязанную на канон оригинала. В ближайшем будущем человечество вступает в новую энергетическую революцию, сопоставимую по значимости с открытием атомной мощности — энергией фотонов. Эту силу добывают из руды, найденной у подножья горы Фудзи, и она обещает решить главные мировые энергетические проблемы. Чтобы заполучить новую энергию, сумасшедший учёный доктор Хелл — одержимый идеей мирового господства — вместе с его союзниками: бароном Асюрой, графом Брокеном и виконт Пигманом, ведут армию механических монстров, созданных из обломков древнегреческих руин, в погоне за лабораторией, изучающей эту энергию. Их атака встречает отпор молодого Кодзи Кабуто, импульсивного пилота Мазингера Зет, сконструированного на мощи фотонной энергии его деда Дзюдзо Кабуто. Но сама схватка вскоре обретает новые масштабы, когда в конфликт включаются посторонние силы: легендарные предания цивилизации Микен и загадочный остров Бардос, а также тайны, спрятанные самим Мазингером Зетом.
