В далёком будущем человечество покинуло разрушенную Землю и направилось к звёздам. Но планы вернуть людей на планету не сложились: вернувшись, они обнаружили, что большая часть поверхности непригодна для жизни, за исключением территории Японии. Чтобы разместить всё население, вокруг Японии возникли новые зоны обитания. Ради поиска способа вернуться к космосу началась реконструкция истории человечества по священной книге Завета. Однако в эпоху реконструкции 1431 года обитатели зон, окружающих Японию, подняли восстание, захватили саму страну и разделили её на феодальные владения, изгнав коренное население. Теперь, в 1648 году э.р., беженцы живут в городе-корабле, который беспрерывно курсирует над материком забытой Родины и находится под надзором Союза восстановления. Появляются слухи о грядущем апокалипсисе и войне, и реконструкция ставится на паузу, чтобы разобраться, что произойдёт после 1648 года. В таких условиях Тори Аой, руководитель Академии Высшей Федерации и президент студенческого совета, возглавляет своих однокурсников в попытке вернуть утраченную историческую землю.
