После неприятного инцидента на выпускном старшей школы Дзёгоро Кобато и Юки Осанаи решают начать новую страницу жизни — в более спокойной и незаметной атмосфере школьного бытия. Их договор прост и амбициозен: стать «маленькими гражданами» — теми, кто не привлекает лишнего внимания и избегает неприятностей. Но мечта о тихой жизни рушится снова и снова: на их пути возникают школьные заговоры, странные происшествия и загадочные тайны, будто сами тянут их в центр событий. Несмотря на стремление держаться в стороне, Кобато сохраняет ярко выраженное остроумие и замечательную наблюдательность, которые всё чаще втягивают его в расследования. Осанаи же, скрывая больше, чем кажется, несёт на себе отпечаток тайны, который может перевернуть многое. Со временем их союз «маленьких граждан» становится опаснее, чем они ожидали, и возможно единственным способом распутать клубок загадок оказывается самообразование и смелость идти вразрез с нормами ради правды и новой судьбы.
