Алхимическое оружие

События разворачиваются вокруг Казуки Муто, старшеклассника, который однажды ночью погибает, пытаясь спасти девушку от монстра, и затем просыпается в своей кровати, уверяя себя, что это был сон. Однако вскоре он осознаёт, что увиденное не было сном: гигантское змееподобное существо нападает и на него, и на его сестру. Девушку, которую он якобы спас, зовут Токико Цумура, и она объясняет, что монстр — гомункул. Спасённой женщине грозит вина за случившееся, и именно поэтому она возвращает Казуки к жизни, поместив в его грудь волшебный медальон — какуганэ, призванный заменить сердце. Какуганэ — алхимическое устройство, которое при активировании принимает форму, зависящую от того, кто им пользуется, тем самым создавая уникальную Бусо Рэнкин («боевую алхимию»). Именно Бусо Рэнкин становится тем оружием, которое способно уничтожать гомункулов. Используя какуганэ, Казуки создаёт собственную Бусо Рэнкин — «Сердце солнечного света», внушительное копьё. В паре с Токико, владеющей Бусо Рэнкин под названием «Юбка Валькирии» — смертельно опасной косой, Казуки вступает в войну против гомункулов и их хозяина.