Анна Саκаки — замкнутая и неловко общающаяся с людьми девочка, у которой практически нет друзей. Она живёт в доме приёмной матери, страдает астмой и любит рисовать. Со временем ей приходится отправиться в небольшой провинциальный городок к дальним родственникам приёмной матери — Киёмасе и Сэцу Оива. В этом городе её внимание притягивает загадочное поместье, которое местные называют Дом на отмели. Анна быстро знакомится с Марни, живущей в этом доме; между ними завязывается крепкая дружба. Но однажды Марни исчезает, и в поместье въезжают новые хозяева — семья Сааки. Тогда Анна начинает узнавать о своей подруге нечто странное и удивительное, что заставляет её по-новому взглянуть на своё прошлое и на саму сущность дружбы.
