Смотреть Аниме «Призрак в доспехах: Вознесение — Призрачная боль»

События разворачиваются в 2027 году, спустя год после завершения войны без применения ядерного оружия. Город Нью-Порт-Сити постепенно восстанавливается после конфликта, но вскоре оказывается под новым ударом — на город опускаются автономные мины, наносящие ущерб городскому ландшафту. В том же периоде становится известно, что высокопоставленный военный чиновник, причастный к взяткам и торговле оружием, погиб при таинственных обстоятельствах. Во время расследования директор отдела общественной безопасности Дайсукэ Арамаки сталкивается с Мотоко Кусанаги, направленной в 501-й секретный отдел. Бато предполагает, что Кусанаги может быть замешана в недавних инцидентах, учитывая, что она не пострадала в бомбардировке. Детектив префектуры Ниихамы Тогауса ведет работу над двумя убийствами, распутывая принципиально разные версии. В то же время Мотоко находится под непрерывным надзором главы 501-го секретного отдела, Куруцу, окруженная агентами-киборгами и другими оперативниками, чьи loyalties и цели остаются под вопросом.