Действие второго сезона выстраивается прямо по завершении арки «Феникс Цукихи», и за полгода в жизни Кёёми Арараги произошло столько, что обычная повседневность уже не кажется ему безопасной. За это время его часто и сурово проверяли на прочность: его разрывали буквально на части, всаживали кровью из ран, насмехались над его именем и клялись порочными ярлыками, угрожали мелкими предметами из школьного канцелярского набора. И это лишь начало его многочисленных испытаний. В личном плане у героя царит полная неразбериха: Сэндзёгахара Хитаги вдруг начинает вести себя крайне странно — ласковые прозвища, бесконечные «улыбочки» в переписке и непрерывный смех. Арараги в панике и не знает, как правильно реагировать на такую перемену. Где же исчезло её холодное выражение лица и колкая ирония? Наслаждаться простой жизнью становится почти невозможным: незавершённые летние задания тянут за собой опасность зомби-апокалипсиса, а рядом подруги вновь сталкиваются с сверхъестественным, и кто готов рисковать ради их спасения — если не он сам? Арараги-сэмпай, старший брат Коёми и сам Арагаги-кун — ответ почти предсказуем. В этом сезоне экранизации подверглись сразу пять из шести новелл ранобэ цикла «Цикл историй: Второй сезон»: Shiro, Kabukimonogatari, Otorimonogatari, Onimonogatari и Koimonogatari.
