После неловкого эпизода на выпускном Дзёгоро Кобато и Юки Осанаи решают начать новую главу в старшей школе, выбрав для себя путь спокойствия и незаметности. Они заключают негласный договор жить как «маленькие граждане» — не высовываться, держаться подальше от конфликтов и лишнего внимания. Но их задумка оказывается хрупкой: школьные интриги, странные происшествия и запутанные тайны словно сами тянут их в центр событий. Кобато старается держаться в стороне, однако его проницательность и способность замечать детали неизбежно тянут его к расследованиям. Осанаи, чья внешняя сдержанность скрывает больше, чем кажется, тоже держит под текстом нечто важное, что постепенно выходит на поверхность. В ходе разворачивающихся загадок дружба и доверие подвергаются испытаниям, а молодым героям приходится осознавать, что быть «маленькими гражданами» значит не просто избегать проблем, а быть готовыми действовать ради других, когда мир вокруг начинает рушиться.
